Evaluating Evo 2 for plant variant effect prediction
この論文は、アブラナ科の生殖隔離遺伝子における実験的に確認された変異を用いた評価を通じて、Evo 2 が機能的に影響を与える変異を識別できることを示し、標準的なスコアリングでは見逃された変異を特定する新たな指標と併せて、植物の GWAS や QTL マッピングにおける因果変異の優先順位付けへの可能性を浮き彫りにしています。
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plant biology
300 件の論文
Endogenous RALF peptide function is required for powdery mildew host colonization
本論文は、エンドウマメ科植物の真菌性病原菌（粉状うどんこ病）が、宿主植物の細胞壁リモデリングや細胞外液の pH 恒常性を制御するエンドジェナス RALF ペプチドシグナルに依存して感染を成立させる新たな感受性メカニズムを解明したものである。
Phyllosphere microbiome-based biocontrol solution against Botrytis cinerea and Plasmopara viticola in grapevine
本論文は、ブドウの葉圏から単離された細菌が単独またはコンソーシアムとして、灰色かび病とべと病に対する生物防除効果を発揮し、作物の持続可能な病害管理に寄与する可能性を示したものである。
Metagenomics analysis for microbial ecology investigation on historical samples: negligible effect of host DNA and optimal analysis strategies
本研究は、歴史的試料における宿主 DNA の除去が微生物生態解析に大きな影響を与えないことを示し、異なる k-mer サイズのデータベースを併用する簡便な 2 段階アプローチを提案することで、自然史コレクションを微生物群集の長期変化研究に活用する新たな基盤を提供しています。
In vitro evaluation of protein-protein interactions in the rice KAI2 ligand signaling complex
本論文は、新規 KAI2 リガンド類似体 dMGer を用いたin vitro 解析により、イネの KAI2 複合体におけるリガンド依存性のタンパク質間相互作用のメカニズムと、OsSMAX1 とそのパラログ D53 を区別するドメインを解明したものである。
A three amino acid sequence gates protein stability control of bHLH104 and iron uptake in Arabidopsis thaliana
本研究は、シロイヌナズナにおいて鉄吸収を制御する転写因子 bHLH104 の C 末端にある「PAA」という 3 個のアミノ酸配列が、E3 リガーゼ BTS によるタンパク質分解を介した安定性制御に不可欠であり、この配列の欠失が鉄蓄積の増加をもたらすことを実証した。
Larval antibiosis to cabbage stem flea beetle (Psylliodes chrysocephala) is absent within oilseed rape (Brassica napus)
本論文は、アブラナ科の主要害虫であるアブラナコナガ（CSFB）の幼虫に対する抗生物質的な抵抗性が、栽培アブラナ（Brassica napus）では欠如している一方で、シロイヌナズナやセイヨウカラシナなどの近縁種では存在し、これらをモデルとして利用することで抵抗性遺伝子の解明と育種への応用が可能であることを示しています。
Reference genome assembly of a tetraploid accession of the tuber crop Tropaeolum tuberosum
本論文は、南米原産のイモ類作物トロペオラム・ツベロサム（マシュマロイモ）の未利用種としての制約を解消するため、PacBio HiFi 配列データを用いて高品質な四倍体参照ゲノムを構築し、その完全性と多様な遺伝子資源への転用可能性を実証したものである。
Presymptomatic plant disease detection with PSNet: A low-cost hyperspectral imaging and RGB fusion framework.
本研究では、3D プリント製の安価な hyperspectral カメラと RGB 画像を融合した PSNet というマルチモーダルフレームワークを開発し、シロイヌナズナの白さび病の初期感染（無症状段階）を高精度に検出可能であることを実証しました。
Utilizing raw rapeseed press cake in foods: A case study on sensory quality and profile of selected bitter compounds in snack bars
本研究は、生菜種搾りかすをスナックバーに添加した際、苦味や渋みなどの官能特性が添加量に依存して変化し、特に KSS やゴイトリンなどの特定の苦味化合物がその感覚に寄与することを明らかにした。
Effector-centred proximity-dependent labelling enables the discovery of cell-surface immune receptors in plants
本論文では、植物の細胞表面免疫受容体やアポプラスト性病原性ターゲットを同定するための効率的な手法として、アポプラスト性エフェクターと TurboID を融合させた近接依存性ラベリング法を開発し、トマトの Cf-2 や Cf-4 などの受容体ならびに XEG1 に対する機能性受容体 SlEix1 の発見に成功したことを報告しています。
Transposons Triggered Dynamic Evolution of MKK3 Gene, a Key Regulator for Seed Dormancy in Barley
本論文は、トランスポゾンが大麦の種子休眠を制御する MKK3 遺伝子の動的な進化を駆動し、その結果として世界中で独立した 3 つの非休眠系統（エチオピアの系統を含む）が誕生したことを明らかにしたものである。
Characterizing key osmolytes and osmoprotectants in drought-stressed Scotch pine: a differential approach
本論文は、乾燥ストレス下におけるスコット松の代謝プロファイリングと再水化実験を組み合わせた新たなアプローチにより、トリプトファン、バリン、リシンが浸透保護物質として、有機酸が浸透調節物質として機能し、一方スクロースや無機イオンは主要な役割を果たさないことを明らかにした。
Effects of agroforestry trees on microclimate and enset (Ensete ventricosum) morphophysiology in South Ethiopia
南エチオピアにおけるこの研究は、散在する樹木がエンスエト（Ensete ventricosum）の生育地における微気候を改善し、樹冠下でエンスエトの形態生理的特性が向上することを示し、アグロフォレストリーシステムへの拡大可能性を提唱しています。
Evolutionary analysis of the exocyst in streptophytes links EXO70 diversification to dominance over SEC3 in membrane targeting
本論文は、植物の陸上進出の初期段階で EXO70 多様化が進み、膜標的化機能の SEC3 から EXO70 への移行が起きたことで、特化した分泌経路の確立が可能になったことを示しています。
PIFI Stabilizes Chloroplast NDH-PSI Supercomplex to Maintain Plastoquinone Redox Balance and PSII Efficiency
本研究は、PIFI タンパク質が NDH-PSI 超複合体を安定化し、チラコイド膜における AET 経路によるプラストキノン還元部位の空間的局在を維持することで、PSII の効率を制御していることを示した。
PHOTOTROPIN-mediated blue light signaling orients the asymmetry of Marchantia polymorpha spores
この論文は、シダ植物の一種であるツノゴケ（Marchantia polymorpha）の胞子において、光受容体フォトロピンとNCH1を介した青色光シグナルが、発生初期の細胞分裂の非対称性と植物体の軸の向きを決定することを明らかにしたものである。
Physiological responses of submerged freshwater macrophytes to multiple stressors
本論文は、メタ分析を通じて淡水沈水植物が複数の人為的ストレス要因に曝された際の生理的反応を体系的に評価し、相加効果が支配的であることを示しつつ、より複雑なストレス条件下でのシナジー効果の潜在性を指摘し、将来の研究モデルとしてStuckenia pectinataを提案している。
Cytosolic MAPK signaling gates chloroplast protein import and photosynthetic capacity
本論文は、細胞質の MAPK シグナル経路が RbcS トランジットペプチドのリン酸化を介してクロロプラストへのタンパク質輸入を制御し、光合成能力を調節する新たなメカニズムを解明したことを報告しています。
Structure of the Arabidopsis receptor kinase SRF6 ectodomain determined from crystals obtained using the LRR crystallisation screen
本論文では、LRR 結晶化スクリーニングを用いて Arabidopsis の受容体キナーゼ SRF6 の細胞外ドメインの高分解能構造を解明し、その特異的な構造特徴と、以前報告されたタンパク質間相互作用の否定を通じて、これらがジベレリン経路以外のシグナル伝達機能を有する可能性を示唆しています。